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SCI科研工作软件使用入门

  • 讲师:李炳蔚 and
  • 编撰整理:陈靓
Medical Research & Publication   2016;2(3):130-131

doi: 10.14218/MRP.2016.056

Published online:

 Author information

一篇高质量SCI 文章的诞生,除了需要一丝不苟的科研态度和超凡卓越的实验能力外,也离不开课题的合理设计(文献调研、筛选分类),数据的准确分析(数据采集、量化)和文章的完美呈现(文献引用、绘制图表)。在这些过程中,借助专业的科研工作软件会使我们的工作事半功倍。

EndNote篇

EndNote 是SCI 的官方软件,支持国际期刊的各种参考文献格式及写作模版,是一款用于海量文献管理和批量参考文献引用的工具软件,自问世起就成为了科研界的必备武器。在此之前,文献调研时从各大数据库中搜集的文献千头万绪,或重复或遗漏,难以管理,阅读所做的笔记则分散各处,查看起来大海捞针,毫无头绪。到写论文时,大量的文献引用往往复杂异常,尤其修改时,牵一发而动全身。这些难题,EndNote 可以凭一己之力,彻底解决。

文献管理

如何将电脑中的文献分类管理?

①在EndNote 中查找文献并分类

②将EndNote 中的文献与电脑中对应的PDF 文件相关联

如何向文献组中添加新文献?

①在PubMed 中查找文献及PMID

②在EndNote 中以PMID 查找文献并关联相应的PDF

引文编辑

如何将参考文献添加入文中?

①将EndNote 与Word 相关联

②在文中选定插入的位置

③在EndNote 中选定文献

④Word 文档中:EndNoteX7→Insert Citation→Insert Selected Citation

编辑参考文献格式

在文末:

①打开EndNote

② Edit→Output Styles→Edit “Circulation”

③ Bibliography→Templates→Journal Article

④ Bibliography→Author Lists

⑤ Bibliography→Layout

⑥ Citations→Templates (文中)

⑦ File→Save As(保存与使用)

⑧ Word → EndNoteX7→Style→Select Another Style

⑨ Update Citations and Bibliography

大量导入文献

Ennote 的文件导入操作是:

①打开PubMed 进行检索、选定

② Send→File→Format→Medline→Create File

③打开EndNote→Import File→Choose File

④ Import Option→Other Files→PubMed(NLM)

⑤ Duplicates→Discard Duplicates

⑥ Import

Image Pro Plus 篇

Image Pro Plus(IPP)是功能强大的2D 和3D 图像处理、增强和分析软件,作为大名鼎鼎的Image-Pro 软件系列中功能最强大的成员之一,具有异常丰富的测量和定制功能。可以用于荧光成像、质量控制、材料成像等多种科研领域。

给图片插标尺

定标

①拍摄测微尺照片,并用IPP 打开

② Measure→Calibration→Spatial Calibration

③ New→命名→Unit→Image

④移动左上角测量线并确定实际长度→输入数字

插入标尺

① Measure→Calibration→Select Spatial Calibration

② Marker→Style→Non-destructive

③选择Marker Length 及标尺颜色

目标的测量与定量

测距

① Measure→Calibration→Select Spatial Calibration

② Measure→Measure Distance

计数

① Measure→Count/Size→Options→Outline Style→Dot

② Manual→Select Colors→用笔选择目标→Close

③ Count→In Range 读数

J面积与累积光密度

① Measure→Calibration→Select Spatial Calibration

② Measure→Count/Size→Options→Outline Style→Filled

③小框Measure→Select Measurements→Area/IOD

④ Manual→Select Colors→用笔选择目标→Close

⑤ Count→View→Statistics

GraphPad Prism 篇

GraphPad Prism 是一款集数据分析和科技作图于一体的数据处理软件。它可以直接输入原始数据,自动进行基本的生物学统计,同时产生高质量的科学图表。虽然在数据统计分析方面的功能不如SAS、SPSS 强大,但是它具有的功能非常实用而精炼,操作简洁方便、图表精美多样是 GraphPad Prism 的特点。

K作组间比较的柱状图

①打开软件直接进入作图向导(或双击进入向导)

② Column → Enter/Import Data

③可选原始数据作图或已知均数标注差作图

④ Create →添加相应数据

⑤ Graphs → Data 1 →图片类型选择Column

⑥完善图片细节

⑦ Results → One-way ANOVA → Multiple Comparisons

⑧选择第二项“两两比较”

⑨手动添加“*”、“#”符号

L多个指标的组间比较

① Grouped→Enter/Import Data

② n 次重复实验(可选已知均数标注差作图)

③ Create→添加相应数据(指标在列,分组在行)

④ Graphs→Data 1→图片类型选择Grouped

⑤ Plot Summary Data→Plot Mean With SD

⑥完善图片细节

M生存曲线

① Survival→Enter/Import Data

② Create→添加相应数据(X为天数,1 为死亡,0 为删失)

③ Graphs→Data 1→图片类型选择及完善

相信通过以上学习,大家对EndNote、Image Pro Plus、GraphPad Prism 的应用都有了初步的了解,在今后的科研工作,它们将会大放异彩,使我们的科研成果广为人知。

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