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文献检索和管理技巧(四)

  • 川 晋
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上一篇题为《如何将PubMed 的文献批量导入 EndNote》的短文,引起了一些网友的关注。有部分网友指出,可以直接通过EndNote 自带的连接PubMed 功能进行检索即可,不必劳神费力地先在PubMed 网页中进行检索,然后再将结果导入EndNote。虽然笔者在文中也指出 EndNote 的检索功能不够强大,不推荐用EndNote 直接检索,但并未详细说明EndNote 的检索有何缺陷。

在本文中,笔者选定了十个比较典型的检索词,分别用网页版的PubMed 和EndNote 连接PubMed 进行检索,通过判断检索结果的数目,比较二者检索的结果是否相同。本次检索的时间为2015 年4 月23 日下午6 时许,结果如(表1)。

表 1

PubMed 和 EndNote 检索结果比较

序号特征Pubmed 网页检索Endnote 联网检索一致否
检索词结果检索词限制字段结果
1缩写ARDS8088ARDSAll fields8088
2作者Cao Xuetao239Cao XuetaoAll fields2
3带连接符miR-132234miR-132All fields234
4带希腊字母interfercn-α66330interfercn-αAll fields66339
5带空格IL 168895IL 1All fields357575
6全称systemic lupus erythematosus59200systemic lupus erythematosus”All fields56836
7整词检索“systemic lupus erythematosus”56255“systemic lupus erythematosus”All fields0
8截词检索inhibit *2094866inhibit *All fields2094866
9限定词段biomarker[ti]12420biomarker[ti]Title12420
10主题词检索“liver Neoplasms/mortality”[Majr]1385“liver Neoplasms/mortality”[Majr]Mesh Major Topic1385

由表1 可见,对于部分检索词,EndNote 的检索结果与网页版PubMed 并不完全相同,比如在网页版PubMed 中检索systemic lupus erythematosus(两侧不加双引号),可以得到59200 条记录;而采用相同的检索词在EndNote 中进行检索,只能得到56836 条检索记录。

如果用“systemic lupus erythematosus”(两侧加双引号)作为检索词在PubMed 中进行检索,表示将systemic lupus erythematosus 作为一个整词检索,即这三个单词必须连续出现,结果可以得到56255 个结果;而在EndNote 中,则没有得到任何检索结果,可见EndNote 可能没有整词检索的功能。

笔者还注意到,如果较为复杂的需要多次运用布尔逻辑进行运算的检索,比如(A or B or C) and (D not E) and (F or G),此时EndNote 就力不从心了,因为据笔者所知,EndNote 在检索时,没有括号的功能,无法对运算顺序进行调整。而在网页版PubMed 中,这种检索方法是很容易实现的。

此外,网页版PubMed 还有很多优势,比如限制出版语言、年龄、性别以及个性化的Filter 等设置,而这些 EndNote 目前是无法办到的。因此,笔者认为,EndNote 和PubMed 之间并不是无缝对接的。所以建议大家在检索文献的时候,尽量采用网页版的PubMed 进行检索,然后将检索结果导入EndNote。

About this Article

Article History
Received Revised Accepted Published
March 15, 2016
DOI http://dx.doi.org/10.14218/MRP.2016.009
  • Medical Research & Publication
  • pISSN 2475-7500
  • eISSN 2475-7543
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川 晋
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