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Nature新闻: 生物医学研究人员疏于验证抗体会削弱研究的可重复性

  • 张媛媛
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Medical Research & Publication   2016;2(3):142-142

doi: 10.14218/MRP.2016.062

位于华盛顿的全球生物标准研究所(the Global Biological Standards Institute (GBSI))是一家致力于通过提高试剂可靠性而促进生物医学研究的非营利性机构。该研究所在去年十月进行的一项调查表明,52% 的研究者试验前没有鉴定细胞系的身份,而细胞系是很容易被一些快速生长细胞污染。

该研究所近来的一项研究表明,只有70% 的研究者会验证商业购买的抗体。这就意味着接近三分之一的初级研究者不会花时间验证试验中用到的抗体1。Royal Institute of Technology 的一位蛋白研究专家Matthias Uhlth 评论说,这种情况的确堪忧。质量低劣的抗体如果与非靶蛋白结合,将引起假阳性,如果未能与靶蛋白结合,又将引起假阴性。这些问题会导致科学家和期刊不得不撤稿,并对科学家的声誉造成巨大的难以挽回的损失。

许多实验室已经报告,因为抗体的问题,浪费了多年的工作:上千的人体样本,以及数十万美元。在参加此次调查的接近400 名生物医学研究人员中,一半以上报告说自己未接受过验证抗体的专业训练。

更惊人的是高级研究人员和初级研究人员在科研实践中的巨大差异!超过10 年科研经验的研究者中,76% 的人都会验证商业来源的抗体。而只有5 年及以下科研经验的研究者中,只有43% 的人会这么做。不验证抗体的人给出的最常见的原因是:这太花费时间了。

验证抗体要比验证细胞复杂的多。抗体是否能正确工作要看具体的试验。例如,有的抗体能够检测到变性的蛋白,却不能检测到未变性的蛋白,或者相反。在某种组织中工作良好的抗体,可能在其他组织或背景中给出假信号。GBSI 的调查表明,18% 的研究者不会根据试验采用不同的验证程序,另外有15% 的人对此不确定。

GBSI 所长Leonard Freedman 认为,由抗体引起的重复性问题既可归咎于质量低劣的抗体,也可归咎于训练不足。但缺乏清晰的、广泛接受的抗体验证指南,以及抗体生产商应该提供哪些信息,却使以上两方面都越来越严重。今年九月,他的团队将在加利福尼亚州阿希洛马市,这个因为发布重组DNA 指南而声名远播的地方,举行一个专题研讨会。抗体生产商、使用者、基金资助者和期刊代表都将参加此次研讨会。Leonard Freedman 说:“我们将锁上门,不放任何人出去,直到我们能产出一套实用的、使用者友好的抗体验证标准”。我们期待这样的承诺。

References

  1. Baker Monya. Biomedical researchers lax about validating antibodies for experiments. Nature 2016
  • Medical Research & Publication
  • pISSN 2475-7500
  • eISSN 2475-7543
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